Lelouch dari Pemberontakan R2

Satu tahun setelah "Pertempuran Penentu Tokyo", bocah laki-laki Britannia Lelouch menjalani kehidupan pelajar biasa di Distrik 11 (sebelumnya Jepang). Namun, selama perjalanan dengan adiknya Rollo, Lelouch bertemu dengan sisa-sisa Ksatria Hitam. Setelah membuat kontrak dengan gadis C.C lagi, kenangan berdebu ditempatkan di depan Lelouch. Sebagai pangeran kekaisaran, Lelouch menggunakan GEASS, kekuatan kepatuhan mutlak, untuk memimpin Ksatria Hitam mendeklarasikan perang terhadap kekaisaran guna membangun dunia di mana semua orang setara dan dunia di mana saudara perempuannya Nunnally bisa bahagia. Dia mengenakan topeng dan menggunakan nama samaran ZERO, tetapi dikalahkan oleh temannya Suzaku dalam "Pertempuran Penentu Tokyo" setahun yang lalu, dan ingatannya dihapus oleh kaisar. Kini, Lelouch yang sudah pulih ingatannya, tidak hanya harus menghadapi kekuatan militer kekaisaran yang kuat, tapi juga saudara palsu Rollo, saudara perempuan Nunnally yang hilang, Aliansi Tiongkok yang tidak mengenal musuh dan teman mereka, serta para Ksatria Hitam yang memiliki perbedaan internal. Menghadapi masalah internal dan eksternal, Lelouch memulai jalan raja kesepian yang dikutuk oleh kekuatan GEASS.