Bagian keenam dari Yu-Gi-Oh! VRAIN

Panggung ceritanya adalah "DEN CITY", sebuah kota dengan sistem Internet yang maju. Ada ruang VR bernama "LINK VRAINS" yang dibangun oleh perusahaan raksasa "SOL Technology" menggunakan teknologi jaringan canggih. Orang-orang antusias untuk merasakan duel baru di ruang VR tersebut. Namun, di "LINK VRAINS", muncul kelompok hacker misterius "Knights of Hanouin" yang menggunakan duel untuk melakukan aktivitas peretasan. Dan tujuan mereka adalah menghancurkan "dunia AI = dunia elektronik" yang ada di suatu tempat di Internet. Namun, saat dunia terancam seperti ini, salah satu duelist berdiri. Dan namanya adalah "Playmaker". Dalam pertarungan legendaris itu, "Playmaker" menggunakan duel yang luar biasa untuk mengalahkan "Ksatria Hainoin" dan berhasil menangkap program AI misterius yang ingin diperoleh oleh "Klub Teknologi SOL" dan "Ksatria Hainouin". Ia pernah menyelamatkan dunia, namun kemudian tiba-tiba menghilang, dan namanya seketika menjadi terkenal dan menjadi legenda di dunia Internet. Dan kini, Fujiki Yusaku, seorang siswa SMA yang merupakan sosok sebenarnya dari "Playmaker", sedang mencoba mencari kebenaran tentang kejadian yang terjadi di masa lalu.