Homeworld Menyerang Kembali

Dalam waktu dekat, bumi akan menjadi tandus dan berbahaya. Ketika makhluk misterius mengambil alih Bumi, umat manusia terpaksa berlindung di Sky Ark, sebuah kota buatan manusia di langit. Seiring bertambahnya jumlah penduduk, ruang menjadi semakin langka. Hanya orang kaya dan berkuasa yang bisa tinggal di Sky Ark, sedangkan orang miskin dan anak yatim diasingkan ke bumi. Di antara mereka ada seorang anak laki-laki bernama Lagos, putra seorang mantan komandan yang gugur dan bertekad untuk menyelamatkan anak-anak yatim piatu dan orang-orang buangan. Untuk kembali ke Sky Ark dan membawa kedamaian kembali ke dunia, dia dan teman-temannya harus melewati reruntuhan Bumi lama dan bertarung melawan kelompok monster alien.