ミッション: インポッシブル 2

スーパーウイルス「キメラ」と抗生物質が輸送中にテロ組織のリーダー、ショーン・アンブローズ（演：ダグレイ・スコット）によって盗まれた。イーサン・ハント（トム・クルーズ演じる）はIMFチームを率い、ウイルスを回収するというCIAの任務を受け入れた。今回、イーサン・ハントは、ショーン・アンブローズの元恋人である女性密告者のニャー・ノードフ・ホール（タンディ・ニュートン）のパートナーを見つけた。イーサン・ハントがニャーの信頼を得る一方、二人は密かに恋に落ちた。しかし、任務を完了するために、イーサン・ハントはナイアが秘密捜査官としてショーン・アンブローズのもとに戻るよう手配しなければならなかった。ニャーはついにウイルスが存在する製薬工場を突き止め、その情報を受け取ったイーサン・ハントはウイルスを破壊する準備をするために製薬工場に向かった。一方、ショーン・アンブローズはニャーが自分のもとに戻るという真の目的を発見し、イーサン・ハントが降伏するまで製薬工場で待つよう人々を組織した。激しい戦いの中で、ニャーはイーサン・ハントの任務完了を助けた