"제로 전쟁 공주"의 두 번째 시즌

아오이 카즈하(Aoi Kazuha)는 전설적인 판도라(노바와 싸울 수 있는 소녀)입니다. 카즈야는 언니의 유산을 이어받기 위해 판도라의 전문학교 '제네티쿠스'에 입학해 '무접촉 여왕' 사티레사 엘 브리짓의 관장이 됐다. 그때부터 그의 삶은 크게 바뀌었다. 인간을 공격하는 이차원 신체 NOVA와의 전투에서 여동생 카즈하 아오이를 잃은 소년 카즈야는 NOVA에 맞서 싸우는 전사와 컨트롤러의 훈련 조직인 Geneticus에 편입되었습니다. 그곳에서 카즈야는 '무접촉 여왕'이라 불리는 소녀, 사틸레사 엘 브리짓을 만났다. 카즈야는 여동생의 모습을 한 사틸자와 사랑에 빠졌고, 계속해서 거절당하면서도 그녀와 함께 전장에 나가며 서서히 거리를 좁혀갔다. 이때 카즈야는 "게네티쿠스"의 상급 조직인 "스바리아이"의 명령에 의해 알래스카 기지로 파견되었다. 그곳에서는 판도라를 인공적으로 만들어내는 'E-판도라 프로젝트'라는 새로운 NOVA 대책이 진행 중이다.