Sekolah Harapan Danganronpa dan Pelajar Sekolah Menengah Terdesak

Kisah ini berlaku di Akademi Puncak Harapan swasta. Syarat kemasukan yang keras dan faedah pengijazahan yang murah memberikan akademi bersejarah ini suasana bangsawan dan golongan elit. Hanya pelajar peringkat sekolah menengah super layak masuk dan belajar. Tahun ini, Naegi Makoto (disuarakan oleh Ogata Emi) menerima notis kemasukan daripada akademi atas alasan "tuah peringkat sekolah tinggi super". Yang peliknya ialah dia tidak menemui sebarang tuah dalam kehidupannya yang biasa. Jika ada, ia adalah kemasukan ini. Dalam kelas ini, terdapat 15 pelajar baru termasuk Naegi Makoto yang kesemuanya merupakan orang yang canggih dalam pelbagai bidang. Bagaimanapun, pada upacara pembukaan, kemunculan Monokuma (disuarakan oleh Enyo Oyama) menjerumuskan mereka ke dalam api penyucian abadi. Pintu keluar terkunci, ruang gelap, peraturan melarikan diri yang kejam, ujian sekolah yang sengit, hanya mereka yang mempunyai darah di tangan mereka boleh menjadi pemenang terakhir dan mendapatkan semula kebebasan mereka. Kali ini, adakah Makoto Naegi yang dikenali sebagai super high school bertuah dapat meneruskan nasibnya?