Kapal Perang Angkasa Yamato 2199

Pada tahun 2199, musuh dari luar sistem suria, Empayar Gamilas, mula menyerang planet lain untuk menyelamatkan planet asal mereka daripada bahaya. Tentera Bumi mengalami kekalahan teruk dalam pertempuran dengan Tentera Diraja Garmilla. Pada masa yang sama, Tentera Imperial Garmilla melancarkan sejumlah besar bom bintang radioaktif ke arah Bumi. Rintangan bumi semakin lemah. Ben dan Gamilas datang membantu planet berkembar Iskandar, menghantar lukisan reka bentuk enjin gelombang dan meriam gelombang ke bumi, dan memaklumkan tentera bumi bahawa planet itu mempunyai peralatan "Cosmic Cleaner D" untuk mengeluarkan tenaga radioaktif. Selepas terputus hubungan dengan Eropah dan Amerika, Angkatan Pertahanan Bumi menggunakan teknologi yang disediakan oleh planet Iskandar untuk mengubah Yamato yang tidur di dasar laut menjadi kapal perang angkasa. Seluruh krew Yamato memulakan perjalanan yang panjang untuk mendapatkan "Pembersih Angkasa D".